BLAST በብሔራዊ የባዮቴክኖሎጂ መረጃ ማዕከል (NCBI) ድህረ ገጽ ላይ እንዲሁም በሌሎች በርካታ ድረ-ገጾች ላይ ጥቅም ላይ የሚውል የኮምፒውተር አልጎሪዝም ነው። BLAST የጥያቄ ዲኤንኤ ቅደም ተከተልን ከተከታታይ የውሂብ ጎታ ጋር በፍጥነት ማመሳሰል እና ማወዳደር ይችላል፣ይህም በመካሄድ ላይ ያለ የጂኖሚክ ምርምር ወሳኝ መሳሪያ ያደርገዋል።
BLAST ዋና ዳታቤዝ ነው?
BLAST በባዮኢንፎርማቲክስ ጥናት ውስጥ በብዛት ጥቅም ላይ የሚውለው ሶፍትዌር ነው። ዋናው ተግባሩ የፍላጎት ቅደም ተከተል የሆነውን የጥያቄውን ቅደም ተከተል በ ትልቅ የውሂብ ጎታ BLAST ውስጥ ካሉ ቅደም ተከተሎች ጋር ማነጻጸር ነው ከዚያም በመረጃ ቋቱ ውስጥ ከሚገኙት ምርጥ ግጥሚያዎች ወይም "መታ" ሪፖርት ያደርጋል። ይህ ቀላል ፕሮግራም ሁለት ዋና መተግበሪያዎች አሉት።
NCBI የውሂብ ጎታ ነው?
የኤንሲቢአይ ቤቶች ከባዮቴክኖሎጂ እና ባዮሜዲሲን ጋር ተዛማጅነት ያላቸው ተከታታይ የውሂብ ጎታዎች እና ለባዮኢንፎርማቲክስ መሳሪያዎች እና አገልግሎቶች ጠቃሚ ግብአት ነው።ዋና ዋና የመረጃ ቋቶች GenBank ለዲኤንኤ ቅደም ተከተሎች እና ፐብሜድ፣ የባዮሜዲካል ስነ-ጽሁፍ መፅሃፍታዊ ዳታቤዝ ያካትታሉ። ሌሎች የውሂብ ጎታዎች የNCBI Epigenomics ዳታቤዝ ያካትታሉ።
BLAST በNCBI የውሂብ ጎታዎች ውስጥ ብቻ ነው የሚሰራው?
BLAST በኤንሲቢአይ ድር ጣቢያ ላይ ይገኛል። በጥያቄ ቅደም ተከተሎች እና በታለመው ዳታቤዝ መሰረት የተለያዩ የBLAST አይነቶች ይገኛሉ።
BLAST ዳታቤዝ እንዴት ነው የሚሰራው?
BLAST እንዴት ነው የሚሰራው? BLAST ሂውሪስቲክ ዘዴ በመጠቀም ግብረ-ሰዶማዊ ቅደም ተከተሎችን ይለያል ይህም በመጀመሪያ በሁለት ተከታታዮች መካከል አጫጭር ግጥሚያዎችን ያገኛል። ስለዚህ, ዘዴው ሙሉውን ተከታታይ ቦታ ግምት ውስጥ አያስገባም. ከመጀመሪያው ግጥሚያ በኋላ BLAST የአካባቢ አሰላለፍ ከእነዚህ የመጀመሪያ ግጥሚያዎች ለመጀመር ይሞክራል።
