BigWig የፋይል ቅርጸት ነው ጥቅጥቅ ያለ እና ቀጣይነት ያለው ውሂብ በጂኖም አሳሽ ትራክ፣ ከዊግል (ዋይግ) ቅርጸት በመቀየር የተፈጠረ። የBigWig ቅርጸት በUCSC ጂኖም ባዮኢንፎርማቲክስ ድረ-ገጽ ላይ ተገልጿል፣ እና የብሮድ ኢንስቲትዩት የፋይል ቅርጸት መመሪያ ተጨማሪ መረጃ ይሰጣል።
bigWig ቅርጸት ምንድነው?
የቢግ ዊግ ቅርጸት ነው ጥቅጥቅ ያለ እና እንደ ግራፍ የሚታይ ቀጣይነት ያለው ዳታየBigWig ፋይሎች መጀመሪያ ላይ ከWIG አይነት ፋይሎች የተፈጠሩ ናቸው፣ የUCSC ፕሮግራም wigToBigWigን በመጠቀም። በአማራጭ፣ የ UCSC ፕሮግራም bedGraphToBigWigን በመጠቀም ከ bedGraph ፋይሎች ትልቅ ዊግ ሊፈጠሩ ይችላሉ።
እንዴት bigWig ፋይልን እጠቀማለሁ?
አዲስ የተፈጠረውን bigWig ፋይል ያንቀሳቅሱ (myBigWig.bw) ለድር ተደራሽ http፣ https፣ ወይም ftp አካባቢ። ዩአርኤሉን ወደ ብጁ ትራክ መግቢያ ቅፅ ይለጥፉ ወይም ነጠላ መስመርን በመጠቀም ብጁ ትራክ ይገንቡ። የብጁ ትራክ መስመር በብጁ ትራክ አስተዳደር ገጽ ላይ ባለው የጽሑፍ ሳጥን ውስጥ ይለጥፉ።
ትልቅ የዊግ ትራክ ምንድን ነው?
BigWig ትራኮች በጠቅላላው ጂኖም ውስጥ ለሚኖሩ ቀጣይ ምልክቶች ትራኮች ናቸው። እንደ ChIP-Seq ሲግናሎች፣አር ኤን ኤ-ሴክ ሲግናሎች፣ወዘተ ያሉትን “ጥሬ” የሙከራ ውጤቶችን ለማሳየት ተስማሚ ናቸው።
እንዴት ትልቅ ዊግ ፋይል መፍጠር እችላለሁ?
bigwig ፋይሎችን ለማመንጨት ብዙ መንገዶች አሉ። ይህ አብዛኛውን ጊዜ መቀየርን ያካትታል. bam ፋይል ወደ ማወዛወዝ ትራክ (. wig) እና ከዚያ የዊግል ትራኩን ወደ ሁለትዮሽ ቢግዊግ (. በመቀየር