በርካታ ተከታታይ አሰላለፍ የተጠበቁ ክልሎችን በፕሮቲን ቤተሰብ ውስጥ ስለሚያሳዩ ከተጣምር አሰላለፍ የበለጠ መረጃ ያቅርቡ። መዋቅራዊ እና ተግባራዊ ጠቀሜታ ያላቸው።
ባለብዙ ተከታታይ አሰላለፍ የማካሄድ አላማ ምንድን ነው?
ከሥነ-ህይወታዊ ቅደም ተከተሎች (አር ኤን ኤ፣ ፕሮቲኖች፣ ዲ ኤን ኤ) ከተሰጠ፣ የኤምኤስኤ ዘዴ አላማ ቅደም ተከተሎችን ወይም የዝግመተ ለውጥ፣ ተግባራዊ ወይም መዋቅራዊ ግንኙነታቸውን በሚያንጸባርቅ መልኩ ለማጣጣም ነው።(ምስል 1)።
በርካታ ተከታታይ አሰላለፍ በዝግመተ ለውጥ ውስጥ እንዴት ይረዳል?
የተጣጣሙ ቅደም ተከተሎች ለብዙ ዓላማዎች ጥቅም ላይ ይውላሉ፡ የልዩነት ቅጦች ግምት፣ ምርጫ፣ የዝግመተ ለውጥ ጊዜ እና ሁነታ፣ የተግባር ክፍሎችን እና ገደቦችን መለየት፣ እና የፊሎጅኔቲክ ታሪክን ጨምሮ። ጥቂቶቹን ለመጥቀስ ያህል።
ባለብዙ ተከታታይ አሰላለፍ ነው?
በርካታ ተከታታይ አሰላለፍ (ኤምኤስኤ) በአጠቃላይ የሶስት ወይም ከዚያ በላይ ባዮሎጂካል ቅደም ተከተሎች (ፕሮቲን ወይም ኑክሊክ አሲድ) ተመሳሳይ ርዝመት ያለው አሰላለፍ ነው ከውጤቱ አንፃር ግብረ-ሰዶማዊነት ሊታወቅ ይችላል እና በተጠኑት ቅደም ተከተሎች መካከል የዝግመተ ለውጥ ግንኙነቶች. … በአካባቢ ክልሎች ላይ የሚያተኩር በጣም ፈጣን MSA መሳሪያ።
በርካታ ተከታታይ አሰላለፍ እንዴት ይፈጠራል?
የክላስተታል ኦሜጋ አልጎሪዝም በ በመጀመሪያ የk-tuple ዘዴን በመጠቀም ጥንድ ጥምር አሰላለፍ በማምረት በማድረግ በርካታ ተከታታይ አሰላለፍ ይፈጥራል። ይህ የ k-means ክላስተር ዘዴ ይከተላል. የመመሪያው ዛፉ ቀጥሎ የሚገነባው UPGMA ዘዴን በመጠቀም ነው።